Poolraum: 03.04.1.03
19.04.2007
In dem Seminar sollen aktuelle Themen aus dem Bereich Cluster und Grid Computing bearbeitet werden. Hierbei wird ein Schwerpunkt auf selbständige praktische Arbeiten gelegt. Die Themen werden in Gruppen von 2-3 Studenten/innen bearbeitet. Die Themen kommen zum einen aus dem Bereich der Arbeitsgruppe Grid Computing von Prof. Schnor zum anderen aus Kooperation mit anderen wissenschaftlichen Einrichtungen in Potsdam wie beispielsweise dem Potsdamer Institut für Klimafolgenforschung(PIK), dem Astrophysikalischen Institut Potsdam (AIP) und dem Albert-Einstein-Institut (AEI).
Motivation dieses Themas sind die aktuellen Multicore-Architekturen von Prozessoren und die Frage, ob geschickte MPI-Implementierungen in der Lage sind von diesen Architekturen zu profitieren oder ob eine Mischung aus OpenMP und MPI besser für Cluster aus Multicore-Rechnern geeignet ist.
Ein in der Arbeitsgruppe Gridcomputing unserer Professur entworfenes Framework zur Migration von Parallelen Anwendungen im Grid soll eingesetzt und auf Herz und Nieren geprüft werden. Dazu ist eine Anwendung um Gridfähigkeiten zu erweitern.
In Zusammenarbeit mit dem Astrophysikalischen Institut Potsdam (AIP) soll in das Simulationstool AMIGA bzw. in das Analysewerkzeug AHF parallele Ein-/Ausgabe mit Hilfe von MPI2 implementiert werden.
In Zusammenarbeit mit der Arbeitsgruppe von Prof. Torsten Schaub soll Platypus, ein Tools zur verteilten Antwortmengen-Berechnung, in Clusterumgebungen untersucht werden.
In Kooperation mit der Professur für Bioinformatik werden folgende Themen auszuwählen sein:
In dieser Aufgabe geht es hauptsächlich um kürzeste Wege in Graphen, die zur Beschreibung von Protein-Interaktionen und anderen biologischen Netzwerken verwendet werden.
Inhalt dieses Themas ist die Automatisierung der Entwicklung und Optimierung von Prädikatoren, die auf einer Support Vektor Maschine basieren.
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